Η βασική αρχή της σύνθεσης DNA

Η σύνθεση του χημικού DNA βασίζεται στη στρατηγική σύνθεσης στερεάς φάσης και στη χημεία του φωσφοραμιδίτη.Διαφορετικό από τη βιολογική σύνθεση DNA, το υλικό στη χημική σύνθεση DNA είναι DMT (4, 4-διμεθοξυτριτύλιο) και δεοξυριβοξυζίτη τροποποιημένο με φωσφοραμιδίτη, όπως φαίνεται στο σχήμα 1. Η σύνθεση DNA πραγματοποιείται στο στερεό υπόστρωμα (μπορούμε να προσφέρουμε διάφοραΣτήλη Oligo Synthesis), δηλαδή CPG (ελεγχόμενος πόρος γυαλί) και PS (πολυστυρένιο), και η όλη σύνθεση πραγματοποιείται σεΣυνθέτης DNA/RNA, που είναι ο κύριος εξοπλισμός μας, έχει διαφορετικό μοντέλο όπως: HY Single Channel Synthesizer, HY-12, HY-192 κ.λπ., η κατεύθυνση σύνθεσης είναι από 3' έως 5', και ένα νουκλεοτίδιο εισάγεται στο στερεό υπόστρωμα μέσω ενός κύκλος σύνθεσης.Ένας τυπικά κύκλος σύνθεσης περιέχει τέσσερα στάδια, Αποπροστασία, Σύζευξη, Πώμα και Οξείδωση (Εικόνα 2).Η αποπροστασία έχει ρυθμιστεί ώστε να αφαιρεί την ομάδα DMT στο στερεό υπόστρωμα ή την ομάδα 5' υδροξυλίου στον προηγούμενο νουκλεοζίτη, το τριχλωροξικό οξύ 3% σε διχλωρομεθάνιο χρησιμοποιείται ως αντιδραστήριο αποπροστασίας.Κατόπιν ο τροποποιημένος με φωσφοραμιδίτη δεοξυριβοξυσίτης αφέθηκε να εκτεθεί σε ομάδα υδροξυλίου με τη βοήθεια ενεργοποιητή, δηλ. 5-αιθυλθειοτετραζόλη ή 4, 5-δικυανοϊμιδαζόλη, σχηματίζοντας τον φωσφιτετριεστέρα (III) και πραγματοποίησε το στάδιο σύζευξης.Εκτελείται ένα στάδιο κάλυψης για τον αποκλεισμό της υδροξυλομάδας που δεν αντέδρασε κατά τη διάρκεια του σταδίου σύζευξης, για να ελαχιστοποιηθεί ο σχηματισμός ανεπιθύμητων αλληλουχιών ελαττωμάτων.Τέλος, ο ασταθής φωσφοριεστέρας (III) οξειδώνεται σε χημικά σταθερό φωσφοριεστέρα (V) με ιώδιο ως οξειδωτικό στην παρούσα πυριδίνη.

Το συντιθέμενο DNA θα μπορούσε να αποκοπεί από το στερεό υπόστρωμα με αμινόλυση, η προστατευμένη ομάδα 2-κυανοαιθυλίου στον φωσφοριεστέρα και το αμίδιο στη νουκλεοβάση διασπάται ταυτόχρονα, οι πλάκες σύνθεσης και οι στήλες σύνθεσης σε ράφι τοποθετούνται απευθείας στον θάλαμο αντίδρασης αποΕξοπλισμός αποπροστασίας.Το ακατέργαστο DNA θα μπορούσε να παρασκευαστεί με HPLC, ηλεκτροφόρηση και OPC κατά παραγγελία, μπορούμε επίσης να σας παρέχουμεΕξοπλισμός καθαρισμούγια μετα-επεξεργασία.

Η βασική αρχή της σύνθεσης DNA1

Εικόνα 1. Η χημική δομή του dABzφωσφοραμιδίτης.

Η βασική αρχή της σύνθεσης DNA2

Εικόνα 2. Ο μηχανισμός της χημικής σύνθεσης DNA.


Ώρα δημοσίευσης: Αυγ-09-2022