Οι παράγοντες που καθορίζουν την αποτελεσματικότητα της σύνθεσης του DNA

Στην τυπική σύνθεση DNA, RNA και μη φυσικών νουκλεϊκών οξέων, το στάδιο της αποπροστασίας και της σύζευξης παίζει κρίσιμους ρόλους.

Το βήμα αποπροστασίας είναι η αφαίρεση της ομάδας DMT στο στερεό υπόστρωμα ή της 5' υδροξυλομάδας στον προηγούμενο νουκλεοζίτη με οργανικό οξύ και η έκθεση της ομάδας υδροξυλίου για το επόμενο στάδιο σύζευξης.Το τριχλωροξικό οξύ 3% σε διχλωρομεθάνιο ή τολουόλιο χρησιμοποιείται κυρίως για τη διεξαγωγή του σταδίου αποπροστασίας.Η συγκέντρωση του τριχλωροξικού οξέος και ο χρόνος αποπροστασίας (χρόνος αποδέσμευσης) κυριαρχούν στην καθαρότητα των τελικών προϊόντων.Η χαμηλή συγκέντρωση και ο ανεπαρκής χρόνος αποφράξεως αφήνουν την ομάδα DMT που δεν έχει αντιδράσει, που μειώνουν την απόδοση και αυξάνουν τις ανεπιθύμητες ακαθαρσίες.Ο μεγάλος χρόνος αποδέσμευσης μπορεί να οδηγήσει στην αποπουρίνη των συντιθέμενων αλληλουχιών, σχηματίζοντας τις απροσδόκητες ακαθαρσίες.

Το βήμα σύζευξης είναι ευαίσθητο στην περιεκτικότητα σε νερό των διαλυτών και στην υγρασία του αέρα.Η συγκέντρωση του νερού στη σύνθεση πρέπει να είναι μικρότερη από 40 ppm, καλύτερα μικρότερη από 25 ppm.Για να διατηρηθεί η κατάσταση της άνυδρης σύνθεσης, η σύνθεση των νουκλεϊκών οξέων θα πρέπει να πραγματοποιείται σε περιβάλλον χαμηλής υγρασίας, επομένως συνιστούμε στους πελάτες μας να χρησιμοποιήσουν τοΔιαλυμένος Εξοπλισμός Αμιδίτες, το οποίο μπορεί να διαλύσει τον κονιοποιημένο ή ελαιώδη φωσφοραμιδίτη σε άνυδρο ακετονιτρίλιο για να αποφευχθεί η επαφή με τον αέρα.

Οι παράγοντες που καθορίζουν την αποτελεσματικότητα της σύνθεσης του DNA5
Οι παράγοντες που καθορίζουν την αποτελεσματικότητα της σύνθεσης του DNA4

Δεδομένου ότι η διάλυση των φωσφοραμιδιτών είναι καλύτερη σε κατάσταση χωρίς νερό και οι μοριακές παγίδες για την προσρόφηση του ίχνους νερού στα αντιδραστήρια και τον αμιδίτη, πρέπει να προετοιμαστεί τοΜοριακές Παγίδες.Συνιστούμε 2 g subsieve για φιάλες αντιδραστηρίων 50-250 ml, 5 g για φιάλες αντιδραστηρίων 250-500 ml, 10 g για φιάλες αντιδραστηρίου 500-1000 ml και 20 g για φιάλες αντιδραστηρίου 1000-2000 ml.

Η διάλυση των φωσφοραμιδιτών θα πρέπει να πραγματοποιείται κάτω από την αδρανή ατμόσφαιρα και η αντικατάσταση των αντιδραστηρίων ενεργοποιητή και του ακετονιτριλίου θα πρέπει να ολοκληρωθεί εγκαίρως.Τα αντιδραστήρια κάλυψης και οξείδωσης πρέπει να χρησιμοποιούνται το συντομότερο δυνατό, τα ανοιγμένα αντιδραστήρια δίνουν μικρότερη διάρκεια ζωής και λιγότερη δραστηριότητα κατά τη διάρκεια της σύνθεσης.


Ώρα δημοσίευσης: Αυγ-09-2022